Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP4Q9UKK3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms