Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MED13Q9UHV7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MED13Q9UHV7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms