Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VPS29Q9UBQ0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VPS29Q9UBQ0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms