Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MBD2Q9UBB5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms