Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TVP23BQ9NYZ1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms