Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM53CQ9NYF3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms