Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMT1Q9NXH9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms