Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHBDL2Q9NX52 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms