Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
OTORQ9NRC9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms