Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
INCENPQ9NQS7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
INCENPQ9NQS7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms