Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DCLRE1BQ9H816 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DCLRE1BQ9H816 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms