Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PARLQ9H300 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms