Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNPKQ9C0E8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNPKQ9C0E8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms