Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP58Q9BVL2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP58Q9BVL2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms