Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EIF3CQ99613 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3CQ99613 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3CQ99613 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3CQ99613 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3CQ99613 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3CQ99613 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3CQ99613 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EIF3CQ99613 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3CQ99613 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms