Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SORT1Q99523 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms