Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRRC1Q96M27 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PRRC1Q96M27 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms