Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A4AQ96JQ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A4AQ96JQ5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms