Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BCANQ96GW7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BCANQ96GW7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms