Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RFT1Q96AA3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RFT1Q96AA3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms