Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATRIPQ8WXE1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATRIPQ8WXE1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms