Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNNM3Q8NE01 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNNM3Q8NE01 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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