Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG16L2Q8NAA4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms