Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYCP3Q8IZU3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYCP3Q8IZU3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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