Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC103Q8IW40 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC103Q8IW40 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms