Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDKL3Q8IVW4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDKL3Q8IVW4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms