Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TCF23Q7RTU1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF23Q7RTU1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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