Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms