Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf47Q6ZRZ4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms