Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
CASC2Q6XLA1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms