Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EDC4Q6P2E9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EDC4Q6P2E9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms