Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CEP55Q53EZ4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CEP55Q53EZ4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms