Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPROQ16827 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPROQ16827 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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