Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPPQ16740 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPPQ16740 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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