Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD8Q15843 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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NEDD8Q15843 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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