Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYTH1Q15438 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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CYTH1Q15438 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYTH1Q15438 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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