Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PDCD1Q15116 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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