Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NAE1Q13564 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NAE1Q13564 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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