Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.241e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.021e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 TEAD4-204ENST00000443986 641 ntTSL 312.7□□□□□ -0.381e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 TEAD4-208ENST00000544666 567 ntTSL 512.19□□□□□ -0.461e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.255e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 STAG3L1-201ENST00000404291 496 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.125e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.958e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.118e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.558e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 SLC39A14-203ENST00000359741 4641 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.598e-7■■■□□ 18.8
ILF3Q12906 CDK5RAP2-214ENST00000481266 970 ntTSL 520.29■□□□□ 0.848e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DDI2-201ENST00000320153 2076 ntTSL 211.04□□□□□ -0.648e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DDI2-203ENST00000483899 497 ntTSL 39.2□□□□□ -0.948e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.958e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.736e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.66e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 FBXO31-204ENST00000565593 2717 ntTSL 518.04■□□□□ 0.486e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 NFATC2IP-202ENST00000562977 638 ntTSL 426.4■■□□□ 1.821e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.541e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 NFATC2IP-203ENST00000564978 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.981e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SRSF4-206ENST00000605204 1399 ntTSL 1 (best)19.11■□□□□ 0.659e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.629e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.83■□□□□ 0.69e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)19.64■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 319.47■□□□□ 0.712e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-216ENST00000444012 605 ntTSL 418.58■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 418.03■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-220ENST00000457757 835 ntTSL 518.03■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-211ENST00000423749 771 ntTSL 517.92■□□□□ 0.462e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-214ENST00000439084 584 ntTSL 314□□□□□ -0.172e-6■■■□□ 18.7
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ILF3Q12906 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.542e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 49.89□□□□□ -0.832e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-206ENST00000409385 2320 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.872e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.122e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 38.01□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 SPATS2L-215ENST00000439395 561 ntTSL 45.39□□□□□ -1.552e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.054e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.24e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.214e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.44e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.564e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.991e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.11e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 NEDD4L-232ENST00000591579 144 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.311e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 NEDD4L-223ENST00000588516 1304 ntTSL 513.02□□□□□ -0.331e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 NEDD4L-233ENST00000591989 233 ntTSL 312.31□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 18.7
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ILF3Q12906 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.051e-6■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-6■■■□□ 18.7
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ILF3Q12906 NEDD4L-231ENST00000590694 165 ntTSL 54.78□□□□□ -1.641e-6■■■□□ 18.7
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ILF3Q12906 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.614e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.924e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.074e-7■■■□□ 18.7
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ILF3Q12906 FNDC3B-209ENST00000478016 554 ntTSL 43.27□□□□□ -1.893e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DNAJC6-207ENST00000494710 1621 ntTSL 524.57■■□□□ 1.521e-9■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.171e-9■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.31e-9■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.379e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DNMT1-228ENST00000592705 5215 ntTSL 1 (best)12.68□□□□□ -0.389e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.469e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DNMT1-202ENST00000359526 5206 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.59e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DNMT1-224ENST00000591764 341 ntTSL 1 (best)8.24□□□□□ -1.099e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 DNMT1-219ENST00000589349 603 ntTSL 48.18□□□□□ -1.19e-7■■■□□ 18.7
ILF3Q12906 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.941e-6■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -11e-6■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.231e-6■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 SPG7-209ENST00000564047 422 ntTSL 212.62□□□□□ -0.393e-6■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 PTPRA-203ENST00000356147 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.947e-10■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 DIP2B-202ENST00000546719 2297 ntTSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.097e-10■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 AC087482.1-201ENST00000558097 540 ntTSL 47.26□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ENSA-209ENST00000369016 923 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.034e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.729e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 519.37■□□□□ 0.699e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)15.31■□□□□ 0.049e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.519e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.619e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)9.85□□□□□ -0.839e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 PTP4A1-207ENST00000639568 532 ntTSL 511.06□□□□□ -0.641e-6■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.417e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.037e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.117e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.117e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.127e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.137e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.197e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZCCHC17-203ENST00000479629 761 ntTSL 211.36□□□□□ -0.597e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 ZCCHC17-209ENST00000627541 1158 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.167e-7■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.211e-8■■■□□ 18.6
ILF3Q12906 RPS3A-209ENST00000510993 762 ntTSL 512.74□□□□□ -0.371e-8■■■□□ 18.6
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