Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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FOXO1Q12778 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXO1Q12778 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXO1Q12778 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXO1Q12778 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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FOXO1Q12778 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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FOXO1Q12778 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FOXO1Q12778 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FOXO1Q12778 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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