Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LOXL1Q08397 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LOXL1Q08397 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms