Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SRSF4Q08170 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SRSF4Q08170 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms