Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCN1BQ07699 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms