Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms