Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK18Q07002 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms