Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPN12Q05209 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms