Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms