Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDK16Q00536 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK16Q00536 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms