Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUCB2P80303 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUCB2P80303 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms