Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL23P62829 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL23P62829 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL23P62829 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL23P62829 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms